Parse Biosciences の Evercode ケミストリーは、ホルマリン固定パラフィン包埋（FFPE）サンプルから、シングルセル分解能での全トランスクリプトーム解析を可能にし、これまで到達不可能であった生物学的情報を明らかにします。
FFPE保存は、貴重な組織コレクションを保管・保全するための主要な手法として長年利用されてきました。しかし、これらのサンプルをシングルセル分解能で解析する場合、限られた情報しか得られませんでした。 さらに、プローブベースの手法では、あらかじめ定義された遺伝子セットに解析が制限されてしまい、細胞が本来持つ生物学的特徴の一部が明らかにならないという課題もありました。
Evercode は、この状況を根本的に変革します。
FFPE組織から全トランスクリプトームを取得することで、Parse は研究者が各細胞で発現しているすべての遺伝子を解析できるようにします。 これにより、これまで可視化できなかった RNA の種類、細胞状態、および遺伝子が明らかになります。
この技術的ブレークスルーにより、広く利用されてきたこの保存手法に対して、全トランスクリプトームシングルセル解析という新たな発見の可能性がもたらされます。
UMAP は、Evercode ケミストリーを用いて約22,000個の核（1細胞あたり20,000リード）から取得した明確に区別される細胞集団を示しています。 このデータは、FFPE保存組織からでも、全トランスクリプトームのシングルセル分解能を明瞭に達成できることを示しています。
Evercode FFPE により、研究者は事前に定義されたプローブパネルの制約を受けることなく、各細胞の完全な分子的ランドスケープを把握できるようになりました。 アイソフォーム、SNP、ノンコーディング RNA を取得し、調節・多様性・細胞状態のより深い層を明らかにします。
Parse の全トランスクリプトーム手法は、数十年にわたり研究を支えてきた組織に対し、現代的なシングルセル解析をもたらします。
Evercode FFPE は、研究者が Parse に期待するのと同等のスケーラビリティとデータ品質を提供します。 数千から数百万の細胞を、何百ものサンプルにわたり、高い信頼性と一貫性をもってプロファイルできます。
バックグラウンドノイズを最小限に抑え、細胞を明確に識別できるようにすることで、Evercode はクラスタリング、遺伝子発現解析、ダウンストリーム解析に信頼して利用できるデータを生成します。
トランスレーショナル・オンコロジーから臨床研究に至るまで、Parse は研究者が貴重なアーカイブ組織から新たな生物学的知見を引き出せるよう支援します。
UMAP は、Evercode ケミストリーを用いて約12,500個の核（1細胞あたり20,000リード）から取得した、明確に区別される細胞集団を示しています。 このデモンストレーションデータは、保存組織から高品質な転写産物の取得とクラスタリングが可能であることを示しています。
FFPE製品の詳細や、次の実験計画のご相談については、どうぞお気軽にお問い合わせください。
